Em sorteio realizado na sede da CBF, na tarde desta quinta-feira, foram definidos os confrontos da primeira fase da Copa do Brasil de 2020, assim como o chaveamento dos confrontos seguintes. O Fluminense estreia diante do Moto Club, no Maranhão. O Tricolor será o visitante no duelo único e jogará por empate.
Caso passe pelo time maranhense, o Fluminense enfrentará, na segunda fase o vencedor de Atlético-BA X Botafogo-PB. Na segunda fase, o Tricolor, se lá estiver, será o mandante do confronto único e ninguém terá vantagem de empatar.
Se avançar à terceira fase, o Fluminense enfrentará quem sair dos seguintes duelos: Novorizontino X Figueirense e Vitória-ES X CSA.