Virou hábito em Copa Libertadores o Fluminense ser prejudicado pela arbitragem. Desde quando voltou ao cenário internacional, em 2008, o Tricolor sofre com árbitros caseiros e incoerentes. Assim como no ano passado numa fase de mata-mata, o Time de Guerreiros acabou atrapalhado por erros de um juiz colombiano e com placar com diferença de um gol.
Nas quartas de final de 2012, José Buitrago ignorou pênalti claro a favor do Flu no segundo tempo em mão de Roncaglia, do Boca Juniors, dentro da área. Além disso, o lateral Carlinhos foi, de forma discutível, expulso pelo “Mr. Bean”. Um ano depois, seu compatriota Wilmar Roldán marcou pênalti inexistente a favor do Emelec na última quarta, decretando a vitória dos equatorianos.