Revelado pelo Fluminense, Marcos Júnior deixou o Tricolor das Laranjeiras na temporada de 2019 para jogar no Japão
O atacante Marcos Júnior, que hoje defende o Sanfrecce Hiroshima, do Japão, foi o último craque da Copa São Paulo de Futebol Júnior a jogar pelo Fluminense. Em 2012, o moleque de Xerém foi eleito o melhor jogador.
Vale lembrar que na campanha daquele ano, o Tricolor das Laranjeiras chegou até decisão. Todavia, foi superado pelo Corinthians pelo placar de 2 a 1. Curiosamente, o zagueiro Antônio Carlos, hoje no Tricolor, fez os dois gols do Alvinegro paulista.
Pelos profissionais, Marcos Júnior participou das campanhas do Tetracampeonato brasileiro e também do estadual do mesmo ano, quando marcou no primeiro jogo da final, na goleada diante do Botafogo por 4 a 1. Em 2016, fez o gol do título do Tricolor na Primeira Liga de 2016, na vitória por 1 a 0 sobre o Athletico-PR.
