Revelado em Xerém e negociado com o Manchester United (ING) sem nem mesmo ter atuado pelo time profissional do Fluminense, Rafael está muito perto de fechar com um rival. Trata-se do Botafogo. Segundo informações do jornalista Thiago Franklin, via Twitter, o lateral-direito deve assinar contrato de três anos e já reforçar a equipe alvinegra na Série B.
Na Europa, o jogador também teve passagem pelo Lyon (FRA) e no Başakşehir (TUR). Atualmente está sem clube.
Mesmo sendo cria do Flu, o jogador nunca escondeu que era torcedor alvinegro. Ele, inclusive, recentemente, teve proposta do Flamengo, mas afirmou que no Rio só jogaria no Tricolor ou no Botafogo.