Revelado pelas categorias de base do Fluminense, onde estreou na equipe profissional em 2010, sendo considerado um projeto de craque, Wellington Silva foi vendido por R$10 milhões, na época, para o Arsenal. Tendo sido emprestado para diversas equipes, para adquirir experiência, o atleta foi indiciado pela Justiça espanhola por conta de participação num esquema de manipulação de resultados.
O nome do brasileiro apareceu na lista do procurador anticorrupção Alejandro Luzón e foi levado a um tribunal de Valencia. Ele teria participado de um esquema para livrar o Zaragoza da queda para a segundona, em 2011, quando ainda defendia o Levante. Atualmente, Wellington Silva defende o Almería-ESP.