Campeão da Copa do Brasil pelo Fluminense em 2007, Junior Cesar foi revelado em Xerém. Depois daquela conquista, participou da bela campanha na Libertadores do ano seguinte, título que esteve próximo das Laranjeiras. Apesar da história tricolor, se diz mais identificado com o Botafogo, atual clube.
– Quero ser lembrado como o Junior Cesar do Botafogo. Agora estou aqui e quero deixar uma marca positiva. Ganhei Carioca no clube, mas quero alcançar algo maior – disse o lateral, que, assim como no Flu, teve duas passagens pelo Alvinegro.