O vencedor da Copa do Brasil 2013, além do direito de disputar a Libertadores do ano seguinte, receberá a bagatela de R$ 6 milhões. São R$ 3 milhões pelo título mais R$ 3 milhões referentes à soma dos valores pagos pelas demais fases. O vice ganhará R$ 4,8 milhões. Os valores foram divulgados nesta quinta pelo site oficial da CBF.
O Fluminense, os demais clubes que participam da Libertadores e o Vasco entram apenas nas oitavas de final da Copa do Brasil, que será disputada no segundo semestre.